在德甲联赛60年历史中一共出现过57家俱乐部，恰逢2013年欧冠冠军纪录片《温布利一代》发布之际，冠军王者将作为“德甲六十年球队巡礼”栏目的压轴俱乐部亮相。号称“南大王”的拜仁慕尼黑，其冠军头衔占据了德国足坛的半壁江山。与其它俱乐部一样，拜仁也是从一家小俱乐部历经无数艰难险阻才走到今天。俱乐部的座右铭是Mia san Mia（我就是我，巴伐利亚方言），自最初建立俱乐部的年轻人身上，独立自信的信条就融入了红色的血液中。

　　地区级别：纽伦堡、奥格斯堡、翁特哈兴（巴伐利亚德比），慕尼黑1860（慕尼黑德比）

　　“让他们走吧，他们会回来的”——那是1900年2月一个阴云密布的下午，11名年轻人从Bäckerhöfl酒馆冲出后，酒馆里的发出的呼喊，随后传来了玻璃瓶摔碎的声音。那一天，慕尼黑男子体操俱乐部（Männer-Turn-Verein，以下简称MTV）的成员们聚集在此，试图将内部纠纷解决。作为MTV俱乐部新成立的足球队的队员，年轻人们要求让足球队加入南德足协，以便稳定持续地参加比赛。然而那时足球还只是一项“英国佬”引入的新鲜运动，相比于俱乐部的“骨干”体操运动员，足球运动员可没多少话语权。于是体操运动员们坚决地驳斥了“小弟”的请求后，足球队员们怒气冲冲的冲入了空旷的玛丽亚广场。在刺骨的寒风下领头的那个人低声说：“他们既然不支持我们的雄心壮志，那我们就离开”。

　　几周后17名足球队的队员们（有几位新加入的成员）手书了一封公告信，表明如果足球队与俱乐部还是无法达成共识，足球队将自立门户，成立一家名为“拜仁”(FB BAYERN)的俱乐部，“拜仁”就是慕尼黑市所在的巴伐利亚州的本地称呼。2月27日，11名足球队的代表与MTV成员再次在Bäckerhöfl酒馆会面——不出所料，意见交换无果。于是年轻的领头人，来自柏林的弗朗茨·约翰(Franz John)带头离开，这次会面则结束得十分平静。十分钟后，足球队一行来到吉塞拉咖啡馆(Café Gisela)，在这里约翰正式宣布了拜仁慕尼黑俱乐部的成立，自己任主席。于是拜仁俱乐部正式诞生，弗朗茨·约翰成为了拜仁俱乐部历史上首任主席，而17名创始成员的签名信目前仍被收藏于拜仁博物馆，被视为俱乐部的创始章程。这群拜仁的领航员将球队球衣定为蓝白色——这是巴伐利亚州州旗的颜色，会员入会会费则为1马克。

　　建队之初，球队主场位于维特尔斯巴赫桥(Wittelsbacherbrücke)，名字叫做“沙伊埃尔恩球场”(Schyrenwiese)。3月对阵1.慕尼黑FC的比赛是队史处子秀，那场比赛拜仁5：2获胜，这很快吸引了其它球员的加入，包括三名从1860“跳槽”的年轻人。开春后，炊具和烤箱制造商瓦姆斯勒(Friedrich Wamsler)将位于克莱门斯大街(Clemensstraße)的一块土地赠予俱乐部作为比赛场地，他可以说是拜仁俱乐部历史上第一位“赞助商”。

　　1906年为了扩大影响力和俱乐部规模，拜仁决定与“慕尼黑运动俱乐部”(Münchner Sport-Club)合并，更名为F.A. Bayern im Münchner SC，白衣红裤也取代了原来的蓝白球衣，从那时起，人们把拜仁称作“红衣军团”(Die Roten)。很快球队就发展成了全国强队，但和当时如日中天的FC弗莱堡以及法兰克福比还略逊一筹。

　　1907年克莱门斯大街开始新建住宅区，球队不得不在几百米外的卡尔·特奥多尔大街(Karl-Theodor-Straße)踢球。时任主席克诺尔(Angelo Knorr)不喜欢这样，于是干脆让球队搬到了东边的利奥波德大街(Leopoldstraße)，在这里，俱乐部拥有了历史上的首个看台，8：1战胜当地对手瓦克(Wacker München)也正式宣告拜仁成为慕尼黑老大。到1908年，拜仁俱乐部拥有了300名会员，下辖8支球队，100余名青少年球员，因此俱乐部也对运行模式做出调整：将行政工作和体育部门分开，球员们专注于竞技。两年后，球队首次首次获得地区冠军，并参加南德锦标赛决赛，出产了队史第一位国脚加布隆斯基(Max Gaberl Gablonsky)。

　　一战期间足球运动暂时停摆，俱乐部状况也时好时坏，到1919/20赛季联赛才恢复。1919年10月，球队与运动俱乐部“分手”，与慕尼黑雅恩体操俱乐部(Turnverein Jahn München)“喜结良缘”，成立了TuSpV Jahn München俱乐部，英国人威廉·汤利(William Townley)任教练，那时拥有700名会员已在慕尼黑遥遥领先。早在战前，拜仁就有聘用英国教练的传统——泰勒、胡尔和查尔斯·格里菲斯，后者是拜仁队史第一位全职教练。

　　然而五年后拜仁就和雅恩俱乐部“离婚”，从此俱乐部秉持“单身主义”，并保持FC Bayern München的名称至今。在苏格兰教练吉姆·麦克弗森(Jim McPherson)的带领下，拜仁在1926年参加了南德足球冠军赛，面对当时最强劲的两个对手，同样来自巴伐利亚的纽伦堡和菲尔特——菲尔特在当时被认为是德国最强的球队。电台在拜仁的老主场绿森林体育场现场直播了这场跌宕起伏的比赛，拜仁4：3险胜菲尔特，首次成为南德冠军。

　　两年后，在匈牙利教练莱奥·魏茨(Leo Weisz)的带领下，球队二夺南德冠军。在全国锦标赛决赛圈，拜仁战胜了哈勒瓦克(FC Wacker Halle)和苏尔兹(SpVgg Sülz 07)进入了半决赛，是俱乐部那时的最大成功。然而在杜伊斯堡，拜仁最终以2:8惨败汉堡。

　　1931/32赛季，拜仁在南德冠军决赛输给了法兰克福，但在以南德亚军的身份获得了全国冠军赛参赛资格。在曼海姆的决赛圈，拜仁先后击败了柏林米涅瓦1893(Minerva 1893 Berlin)和开姆尼茨警察(Polizei SV Chemnitz)首次挺进决赛，随后一鼓作气，以2：0击败了宿敌，五届全国冠军纽伦堡。1932年6月12日，这是拜仁慕尼黑首次称霸全国的日子。

　　然而1933年起形势急转直下，希特勒掌权后，时任主席库尔特·兰道尔(Kurt Landauer)因其犹太血统在政治压力下辞职，同为犹太人后裔的主教练多姆比(Dombi，全能选手，同时任教练、理疗师、秘书和主席之一)不久后也移居瑞士。新任主教练陶歇特(Hans Tauchert)因未能延续以往的辉煌，没多久就被路德维希·霍夫曼(Ludwig Hofmann)取代。然而没多久，霍夫曼就不幸因咽喉疾病去世。此后俱乐部在泥潭中越陷越深，1939年，拜仁慕尼黑历史上首次降级。

　　为了缩短路程和节省油费，拜仁由参加巴伐利亚高卢联赛改为参加南巴伐利亚高卢联赛，1944年红衣军团再次赢得南德冠军，但在全国锦标赛16强被曼海姆淘汰。同年7月13日，拜仁的办公室被炸毁，部分档案只剩灰烬。次年拜仁在康尼·海德坎普(Conny Heidkamp)的带领下再次进入全国冠军赛决赛，不过由于二战来到尾声，当年的决赛并未举行。而由于主场绿森林体育场在1943年被炸毁，那些年拜仁辗转Dante体育场、Schlierseestraße球场和Hypobank体育场，1945年8月才重回故地。